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ライフサイエンス統合データベースセンターの五斗進教授、東京科学大学(Science Tokyo)生命理工学院 生命理工学系の山田拓司准教授、新潟大学 医学部メディカルAIセンターの奥田修二郎教授らの研究グループは、腸内細菌の代謝経路に特化したデータベース「Enteropathway」を公開しました。
腸内細菌の研究は近年急速に進展していますが、その代謝経路に関する情報は限定的でした。そこで研究グループは今回、そうした腸内細菌の代謝経路のデータを網羅的に集めた革新的なデータベース「Enteropathway」を開発しました。このEnteropathwayは、化合物、酵素反応、代謝経路のデータを統合した、ヒト腸内細菌叢の包括的な代謝データベースであり、研究者や医療従事者が腸内細菌の働きや、その複雑な代謝ネットワークをより深く理解するための貴重なリソースとなると期待されます。
腸内細菌の代謝経路データベース「Enteropathway」を公開-疾患や健康状態と関連する細菌代謝パターンの解明に期待- (PDFファイル)
掲載誌:Briefings in Bioinformatics 論文タイトル:Enteropathway: the metabolic pathway database for the human gut microbiota 著者: Hirotsugu Shiroma, Youssef Darzi, Etsuko Terajima, Zenichi Nakagawa, Hirotaka Tsuchikura, Naoki Tsukuda, Yuki Moriya, Shujiro Okuda, Susumu Goto, Takuji Yamada DOI:10.1093/bib/bbae419